Entre el 3 y 6 de noviembre de 2020 como parte del proyecto SATREPS MACH, el Dr. Nagai del Instituto Nacional de Investigación de Ciencias Pesqueras visitó el Laboratorio de Genómica y Ecología Ambiental de la Universidad de Hiroshima.
El propósito de la visita fue detectar rápidamente posibles bacterias alguicidas y utilizar la información para cálculos de regresión asociados con la floración de las algas. Para ello, examinamos muestras de floración mediante amplificación, purificación y la secuenciación del ADN bacteriano en las muestras a través de NGS (secuenciación de última generación) en un plazo menor a 15 horas.
En este experimento, el tiempo requerido para finalizar todo el proceso con 18 muestras fue de 10 horas, por debajo del límite presupuestado de 15 horas. Es probable que este tiempo pueda ser acotado aún mas una vez optimizado el procedimiento.
Uno de los objetivos del proyecto SATREPS-MACH es realizar análisis holobiómicos para entender la influencia bacteriana en la dinámica ambiental de las floraciones de algas.
Un análisis microbiano rápido de las muestras de agua de mar es esencial para lograr este objetivo. El procedimiento utilizado este experimento demostró que el método es valioso para realizar determinaciones holobiómicas en tiempo real, así como beneficioso para otros investigadores que buscan intensamente una relación bacteriana con las floraciones de algas nocivas.
Esperamos un mayor progreso en el proyecto MACH mediante implementación de esta metodología rápida de análisis microbiano. Agradecemos a la Universidad de Hiroshima por la gestión que permitió utilizar sus instalaciones bajo el status de pandemia.
